Erste Schritte

Die folgenden kleinen Beispiele sollen kurz die wichtigsten Schritte auf Brutus erklären. Das erste Beispiel erläutert anhand eines seriellen (= nicht-parallelisierten) Skripts, wie man R-Skripte auf Brutus kopiert, dort ausführt, und anschliessend die berechneten Daten von Brutus zurückkopiert. Die folgen zwei Beispiele geben eine kurze Einführung in die Parallelisierung, entweder mit Shared Memory-Programmierung (OpenMP) oder mit Datenaustausch zwischen unabhängig rechnenden Prozessen (MPI).

Mit den folgenden kurzen Beispielen und dem Brutus wiki sollte man schon ziemlich weit kommen. Bei Problemen frägt man am besten bei jemandem nach, der oft auf Brutus arbeitet. Zum Beispiel: Alain, Bernd, Daniel, Diego oder Markus.

1. Beispiel: Einfaches R-Skript
2. Beispiel: OpenMP (Open Multi-Processing (aka "multicore"))
3. Beispiel: MPI